Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CMPK1P30085 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CMPK1P30085 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CMPK1P30085 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CMPK1P30085 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CMPK1P30085 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CMPK1P30085 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CMPK1P30085 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CMPK1P30085 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CMPK1P30085 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CMPK1P30085 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CMPK1P30085 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CMPK1P30085 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CMPK1P30085 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CMPK1P30085 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CMPK1P30085 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CMPK1P30085 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CMPK1P30085 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CMPK1P30085 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CMPK1P30085 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CMPK1P30085 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CMPK1P30085 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CMPK1P30085 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CMPK1P30085 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CMPK1P30085 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CMPK1P30085 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CMPK1P30085 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CMPK1P30085 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CMPK1P30085 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CMPK1P30085 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CMPK1P30085 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CMPK1P30085 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CMPK1P30085 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CMPK1P30085 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CMPK1P30085 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CMPK1P30085 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CMPK1P30085 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CMPK1P30085 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CMPK1P30085 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CMPK1P30085 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CMPK1P30085 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CMPK1P30085 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CMPK1P30085 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CMPK1P30085 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CMPK1P30085 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CMPK1P30085 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMPK1P30085 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMPK1P30085 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMPK1P30085 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMPK1P30085 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMPK1P30085 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMPK1P30085 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMPK1P30085 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMPK1P30085 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMPK1P30085 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMPK1P30085 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMPK1P30085 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMPK1P30085 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CMPK1P30085 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMPK1P30085 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMPK1P30085 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMPK1P30085 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMPK1P30085 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMPK1P30085 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMPK1P30085 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CMPK1P30085 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMPK1P30085 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMPK1P30085 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMPK1P30085 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMPK1P30085 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMPK1P30085 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMPK1P30085 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMPK1P30085 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMPK1P30085 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMPK1P30085 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CMPK1P30085 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMPK1P30085 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CMPK1P30085 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CMPK1P30085 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CMPK1P30085 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CMPK1P30085 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CMPK1P30085 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CMPK1P30085 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CMPK1P30085 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CMPK1P30085 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CMPK1P30085 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CMPK1P30085 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CMPK1P30085 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CMPK1P30085 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CMPK1P30085 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CMPK1P30085 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CMPK1P30085 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CMPK1P30085 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CMPK1P30085 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CMPK1P30085 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CMPK1P30085 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMPK1P30085 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMPK1P30085 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMPK1P30085 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMPK1P30085 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms