Protein–RNA interactions for Protein: P29400

COL4A5, Collagen alpha-5(IV) chain, humanhuman

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Length 1,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A5P29400 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
COL4A5P29400 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
COL4A5P29400 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
COL4A5P29400 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
COL4A5P29400 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
COL4A5P29400 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
COL4A5P29400 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
COL4A5P29400 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
COL4A5P29400 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
COL4A5P29400 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COL4A5P29400 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COL4A5P29400 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
COL4A5P29400 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
COL4A5P29400 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COL4A5P29400 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
COL4A5P29400 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
COL4A5P29400 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
COL4A5P29400 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
COL4A5P29400 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
COL4A5P29400 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
COL4A5P29400 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
COL4A5P29400 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
COL4A5P29400 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
COL4A5P29400 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
COL4A5P29400 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
COL4A5P29400 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
COL4A5P29400 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
COL4A5P29400 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
COL4A5P29400 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
COL4A5P29400 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
COL4A5P29400 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
COL4A5P29400 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
COL4A5P29400 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
COL4A5P29400 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
COL4A5P29400 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
COL4A5P29400 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
COL4A5P29400 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
COL4A5P29400 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
COL4A5P29400 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
COL4A5P29400 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
COL4A5P29400 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
COL4A5P29400 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
COL4A5P29400 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
COL4A5P29400 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
COL4A5P29400 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
COL4A5P29400 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
COL4A5P29400 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
COL4A5P29400 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
COL4A5P29400 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
COL4A5P29400 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
COL4A5P29400 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
COL4A5P29400 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL4A5P29400 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL4A5P29400 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL4A5P29400 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL4A5P29400 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
COL4A5P29400 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL4A5P29400 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL4A5P29400 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL4A5P29400 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL4A5P29400 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL4A5P29400 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL4A5P29400 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL4A5P29400 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL4A5P29400 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL4A5P29400 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL4A5P29400 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL4A5P29400 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL4A5P29400 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL4A5P29400 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL4A5P29400 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL4A5P29400 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL4A5P29400 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL4A5P29400 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL4A5P29400 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL4A5P29400 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
COL4A5P29400 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL4A5P29400 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL4A5P29400 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL4A5P29400 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL4A5P29400 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL4A5P29400 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL4A5P29400 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL4A5P29400 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL4A5P29400 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL4A5P29400 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL4A5P29400 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL4A5P29400 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL4A5P29400 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL4A5P29400 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL4A5P29400 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL4A5P29400 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL4A5P29400 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL4A5P29400 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL4A5P29400 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COL4A5P29400 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
COL4A5P29400 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
COL4A5P29400 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COL4A5P29400 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
COL4A5P29400 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
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