Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARID4AP29374 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARID4AP29374 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARID4AP29374 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARID4AP29374 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ARID4AP29374 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ARID4AP29374 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARID4AP29374 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARID4AP29374 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARID4AP29374 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARID4AP29374 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARID4AP29374 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARID4AP29374 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARID4AP29374 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARID4AP29374 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARID4AP29374 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARID4AP29374 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARID4AP29374 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARID4AP29374 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARID4AP29374 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARID4AP29374 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARID4AP29374 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARID4AP29374 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARID4AP29374 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARID4AP29374 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARID4AP29374 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARID4AP29374 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARID4AP29374 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARID4AP29374 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARID4AP29374 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARID4AP29374 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARID4AP29374 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARID4AP29374 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARID4AP29374 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARID4AP29374 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARID4AP29374 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARID4AP29374 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARID4AP29374 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARID4AP29374 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARID4AP29374 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARID4AP29374 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARID4AP29374 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARID4AP29374 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARID4AP29374 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARID4AP29374 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARID4AP29374 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARID4AP29374 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARID4AP29374 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARID4AP29374 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARID4AP29374 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARID4AP29374 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARID4AP29374 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARID4AP29374 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARID4AP29374 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARID4AP29374 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARID4AP29374 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ARID4AP29374 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARID4AP29374 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARID4AP29374 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARID4AP29374 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARID4AP29374 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARID4AP29374 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARID4AP29374 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARID4AP29374 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARID4AP29374 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARID4AP29374 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARID4AP29374 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARID4AP29374 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARID4AP29374 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARID4AP29374 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARID4AP29374 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARID4AP29374 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARID4AP29374 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARID4AP29374 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARID4AP29374 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARID4AP29374 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARID4AP29374 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARID4AP29374 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARID4AP29374 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARID4AP29374 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARID4AP29374 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARID4AP29374 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARID4AP29374 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARID4AP29374 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARID4AP29374 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARID4AP29374 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ARID4AP29374 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARID4AP29374 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARID4AP29374 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARID4AP29374 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ARID4AP29374 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARID4AP29374 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ARID4AP29374 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARID4AP29374 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARID4AP29374 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARID4AP29374 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARID4AP29374 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARID4AP29374 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARID4AP29374 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ARID4AP29374 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms