Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HMGB2P26583 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
HMGB2P26583 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HMGB2P26583 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HMGB2P26583 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HMGB2P26583 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HMGB2P26583 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HMGB2P26583 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HMGB2P26583 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
HMGB2P26583 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HMGB2P26583 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HMGB2P26583 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HMGB2P26583 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HMGB2P26583 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HMGB2P26583 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HMGB2P26583 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HMGB2P26583 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HMGB2P26583 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HMGB2P26583 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HMGB2P26583 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HMGB2P26583 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
HMGB2P26583 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HMGB2P26583 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HMGB2P26583 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HMGB2P26583 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HMGB2P26583 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HMGB2P26583 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HMGB2P26583 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HMGB2P26583 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HMGB2P26583 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HMGB2P26583 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HMGB2P26583 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HMGB2P26583 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
HMGB2P26583 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HMGB2P26583 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HMGB2P26583 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HMGB2P26583 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HMGB2P26583 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HMGB2P26583 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HMGB2P26583 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HMGB2P26583 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HMGB2P26583 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HMGB2P26583 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HMGB2P26583 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HMGB2P26583 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HMGB2P26583 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HMGB2P26583 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
HMGB2P26583 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
HMGB2P26583 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
HMGB2P26583 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HMGB2P26583 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HMGB2P26583 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
HMGB2P26583 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HMGB2P26583 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HMGB2P26583 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HMGB2P26583 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HMGB2P26583 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
HMGB2P26583 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HMGB2P26583 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HMGB2P26583 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HMGB2P26583 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HMGB2P26583 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HMGB2P26583 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HMGB2P26583 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
HMGB2P26583 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HMGB2P26583 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HMGB2P26583 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HMGB2P26583 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
HMGB2P26583 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HMGB2P26583 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HMGB2P26583 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HMGB2P26583 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HMGB2P26583 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HMGB2P26583 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HMGB2P26583 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HMGB2P26583 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HMGB2P26583 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HMGB2P26583 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HMGB2P26583 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HMGB2P26583 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HMGB2P26583 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HMGB2P26583 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HMGB2P26583 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HMGB2P26583 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HMGB2P26583 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
HMGB2P26583 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HMGB2P26583 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HMGB2P26583 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HMGB2P26583 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HMGB2P26583 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HMGB2P26583 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HMGB2P26583 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HMGB2P26583 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HMGB2P26583 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HMGB2P26583 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HMGB2P26583 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HMGB2P26583 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HMGB2P26583 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
HMGB2P26583 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HMGB2P26583 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms