Protein–RNA interactions for Protein: P22670

RFX1, MHC class II regulatory factor RFX1, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX1P22670 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RFX1P22670 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFX1P22670 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFX1P22670 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFX1P22670 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFX1P22670 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFX1P22670 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFX1P22670 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFX1P22670 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFX1P22670 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFX1P22670 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFX1P22670 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFX1P22670 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFX1P22670 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFX1P22670 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFX1P22670 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFX1P22670 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFX1P22670 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFX1P22670 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFX1P22670 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFX1P22670 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFX1P22670 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RFX1P22670 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RFX1P22670 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RFX1P22670 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RFX1P22670 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RFX1P22670 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RFX1P22670 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RFX1P22670 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RFX1P22670 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RFX1P22670 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RFX1P22670 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RFX1P22670 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RFX1P22670 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RFX1P22670 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RFX1P22670 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RFX1P22670 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RFX1P22670 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFX1P22670 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFX1P22670 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFX1P22670 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFX1P22670 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFX1P22670 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFX1P22670 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFX1P22670 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFX1P22670 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFX1P22670 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFX1P22670 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFX1P22670 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFX1P22670 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFX1P22670 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFX1P22670 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFX1P22670 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFX1P22670 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFX1P22670 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFX1P22670 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFX1P22670 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFX1P22670 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFX1P22670 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFX1P22670 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RFX1P22670 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RFX1P22670 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RFX1P22670 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RFX1P22670 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RFX1P22670 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RFX1P22670 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RFX1P22670 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RFX1P22670 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RFX1P22670 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RFX1P22670 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RFX1P22670 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RFX1P22670 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFX1P22670 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFX1P22670 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFX1P22670 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFX1P22670 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFX1P22670 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFX1P22670 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFX1P22670 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFX1P22670 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFX1P22670 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFX1P22670 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFX1P22670 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFX1P22670 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFX1P22670 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFX1P22670 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFX1P22670 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFX1P22670 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFX1P22670 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFX1P22670 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFX1P22670 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFX1P22670 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFX1P22670 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFX1P22670 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFX1P22670 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFX1P22670 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFX1P22670 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFX1P22670 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFX1P22670 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFX1P22670 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms