Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGFR3P22607 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGFR3P22607 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGFR3P22607 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGFR3P22607 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGFR3P22607 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGFR3P22607 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGFR3P22607 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGFR3P22607 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGFR3P22607 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGFR3P22607 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGFR3P22607 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGFR3P22607 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGFR3P22607 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGFR3P22607 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGFR3P22607 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGFR3P22607 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGFR3P22607 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FGFR3P22607 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGFR3P22607 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGFR3P22607 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGFR3P22607 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGFR3P22607 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGFR3P22607 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGFR3P22607 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FGFR3P22607 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGFR3P22607 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGFR3P22607 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGFR3P22607 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGFR3P22607 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGFR3P22607 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGFR3P22607 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGFR3P22607 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGFR3P22607 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGFR3P22607 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGFR3P22607 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGFR3P22607 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGFR3P22607 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FGFR3P22607 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FGFR3P22607 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGFR3P22607 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGFR3P22607 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGFR3P22607 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGFR3P22607 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGFR3P22607 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGFR3P22607 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGFR3P22607 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGFR3P22607 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGFR3P22607 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FGFR3P22607 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGFR3P22607 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGFR3P22607 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGFR3P22607 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGFR3P22607 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGFR3P22607 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGFR3P22607 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGFR3P22607 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGFR3P22607 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGFR3P22607 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGFR3P22607 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGFR3P22607 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGFR3P22607 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGFR3P22607 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGFR3P22607 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGFR3P22607 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGFR3P22607 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGFR3P22607 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGFR3P22607 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGFR3P22607 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGFR3P22607 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGFR3P22607 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGFR3P22607 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGFR3P22607 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FGFR3P22607 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FGFR3P22607 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FGFR3P22607 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FGFR3P22607 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FGFR3P22607 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FGFR3P22607 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FGFR3P22607 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FGFR3P22607 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FGFR3P22607 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FGFR3P22607 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FGFR3P22607 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FGFR3P22607 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FGFR3P22607 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGFR3P22607 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGFR3P22607 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGFR3P22607 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGFR3P22607 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGFR3P22607 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGFR3P22607 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGFR3P22607 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGFR3P22607 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGFR3P22607 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGFR3P22607 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGFR3P22607 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGFR3P22607 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGFR3P22607 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGFR3P22607 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms