Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms