Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMB1P20618 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMB1P20618 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMB1P20618 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMB1P20618 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMB1P20618 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMB1P20618 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMB1P20618 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB1P20618 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB1P20618 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB1P20618 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB1P20618 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB1P20618 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB1P20618 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB1P20618 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB1P20618 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB1P20618 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB1P20618 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMB1P20618 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMB1P20618 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMB1P20618 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMB1P20618 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMB1P20618 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMB1P20618 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMB1P20618 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMB1P20618 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMB1P20618 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMB1P20618 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMB1P20618 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMB1P20618 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMB1P20618 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMB1P20618 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMB1P20618 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMB1P20618 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMB1P20618 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMB1P20618 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMB1P20618 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMB1P20618 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMB1P20618 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMB1P20618 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMB1P20618 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMB1P20618 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMB1P20618 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMB1P20618 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMB1P20618 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMB1P20618 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMB1P20618 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMB1P20618 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMB1P20618 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMB1P20618 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMB1P20618 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMB1P20618 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMB1P20618 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMB1P20618 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMB1P20618 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMB1P20618 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMB1P20618 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMB1P20618 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMB1P20618 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMB1P20618 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMB1P20618 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMB1P20618 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMB1P20618 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMB1P20618 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMB1P20618 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMB1P20618 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMB1P20618 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMB1P20618 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMB1P20618 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMB1P20618 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMB1P20618 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMB1P20618 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMB1P20618 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMB1P20618 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMB1P20618 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMB1P20618 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PSMB1P20618 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PSMB1P20618 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PSMB1P20618 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PSMB1P20618 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PSMB1P20618 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMB1P20618 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms