Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATP2B1P20020 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATP2B1P20020 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP2B1P20020 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP2B1P20020 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP2B1P20020 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP2B1P20020 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP2B1P20020 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP2B1P20020 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP2B1P20020 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP2B1P20020 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP2B1P20020 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP2B1P20020 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP2B1P20020 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP2B1P20020 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP2B1P20020 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP2B1P20020 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP2B1P20020 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP2B1P20020 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP2B1P20020 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP2B1P20020 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP2B1P20020 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP2B1P20020 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP2B1P20020 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP2B1P20020 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP2B1P20020 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP2B1P20020 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP2B1P20020 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP2B1P20020 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP2B1P20020 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP2B1P20020 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP2B1P20020 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP2B1P20020 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP2B1P20020 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP2B1P20020 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP2B1P20020 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP2B1P20020 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP2B1P20020 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP2B1P20020 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP2B1P20020 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP2B1P20020 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP2B1P20020 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP2B1P20020 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP2B1P20020 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP2B1P20020 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP2B1P20020 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP2B1P20020 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP2B1P20020 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP2B1P20020 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP2B1P20020 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP2B1P20020 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP2B1P20020 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP2B1P20020 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP2B1P20020 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP2B1P20020 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP2B1P20020 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP2B1P20020 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP2B1P20020 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP2B1P20020 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP2B1P20020 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP2B1P20020 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP2B1P20020 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP2B1P20020 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP2B1P20020 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP2B1P20020 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP2B1P20020 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP2B1P20020 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP2B1P20020 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP2B1P20020 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP2B1P20020 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP2B1P20020 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP2B1P20020 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP2B1P20020 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP2B1P20020 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP2B1P20020 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP2B1P20020 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATP2B1P20020 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATP2B1P20020 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATP2B1P20020 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATP2B1P20020 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP2B1P20020 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP2B1P20020 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP2B1P20020 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP2B1P20020 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP2B1P20020 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP2B1P20020 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP2B1P20020 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP2B1P20020 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP2B1P20020 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP2B1P20020 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP2B1P20020 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP2B1P20020 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP2B1P20020 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP2B1P20020 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP2B1P20020 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP2B1P20020 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP2B1P20020 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP2B1P20020 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2B1P20020 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2B1P20020 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms