Protein–RNA interactions for Protein: P19532

TFE3, Transcription factor E3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3P19532 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFE3P19532 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFE3P19532 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFE3P19532 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFE3P19532 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFE3P19532 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFE3P19532 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFE3P19532 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFE3P19532 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFE3P19532 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFE3P19532 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFE3P19532 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFE3P19532 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFE3P19532 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFE3P19532 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFE3P19532 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TFE3P19532 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFE3P19532 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TFE3P19532 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFE3P19532 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFE3P19532 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TFE3P19532 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFE3P19532 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFE3P19532 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFE3P19532 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFE3P19532 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFE3P19532 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFE3P19532 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFE3P19532 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFE3P19532 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFE3P19532 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFE3P19532 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFE3P19532 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFE3P19532 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFE3P19532 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TFE3P19532 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFE3P19532 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFE3P19532 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFE3P19532 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TFE3P19532 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TFE3P19532 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFE3P19532 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFE3P19532 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFE3P19532 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFE3P19532 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFE3P19532 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFE3P19532 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TFE3P19532 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFE3P19532 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TFE3P19532 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TFE3P19532 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TFE3P19532 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TFE3P19532 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TFE3P19532 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TFE3P19532 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TFE3P19532 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TFE3P19532 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TFE3P19532 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TFE3P19532 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TFE3P19532 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TFE3P19532 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TFE3P19532 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TFE3P19532 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TFE3P19532 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TFE3P19532 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TFE3P19532 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TFE3P19532 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TFE3P19532 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TFE3P19532 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TFE3P19532 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TFE3P19532 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TFE3P19532 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TFE3P19532 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TFE3P19532 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TFE3P19532 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TFE3P19532 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TFE3P19532 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFE3P19532 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFE3P19532 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFE3P19532 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFE3P19532 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TFE3P19532 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFE3P19532 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TFE3P19532 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFE3P19532 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFE3P19532 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFE3P19532 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFE3P19532 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFE3P19532 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFE3P19532 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFE3P19532 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFE3P19532 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFE3P19532 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFE3P19532 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFE3P19532 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFE3P19532 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFE3P19532 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TFE3P19532 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFE3P19532 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFE3P19532 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 848.3 ms