Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR2CP19387 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR2CP19387 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR2CP19387 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR2CP19387 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR2CP19387 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR2CP19387 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR2CP19387 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2CP19387 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2CP19387 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2CP19387 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2CP19387 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2CP19387 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2CP19387 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2CP19387 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2CP19387 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2CP19387 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2CP19387 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2CP19387 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2CP19387 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2CP19387 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2CP19387 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2CP19387 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2CP19387 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2CP19387 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2CP19387 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2CP19387 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2CP19387 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2CP19387 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2CP19387 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR2CP19387 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR2CP19387 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR2CP19387 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR2CP19387 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR2CP19387 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR2CP19387 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR2CP19387 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR2CP19387 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR2CP19387 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR2CP19387 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms