Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
EGR1P18146 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
EGR1P18146 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EGR1P18146 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGR1P18146 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGR1P18146 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGR1P18146 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGR1P18146 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGR1P18146 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGR1P18146 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EGR1P18146 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGR1P18146 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGR1P18146 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGR1P18146 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGR1P18146 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGR1P18146 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EGR1P18146 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EGR1P18146 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EGR1P18146 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EGR1P18146 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EGR1P18146 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EGR1P18146 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
EGR1P18146 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EGR1P18146 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EGR1P18146 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EGR1P18146 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EGR1P18146 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EGR1P18146 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EGR1P18146 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EGR1P18146 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EGR1P18146 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EGR1P18146 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EGR1P18146 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EGR1P18146 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EGR1P18146 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EGR1P18146 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EGR1P18146 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EGR1P18146 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EGR1P18146 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EGR1P18146 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EGR1P18146 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGR1P18146 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGR1P18146 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
EGR1P18146 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGR1P18146 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGR1P18146 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGR1P18146 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGR1P18146 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGR1P18146 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGR1P18146 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGR1P18146 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGR1P18146 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGR1P18146 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGR1P18146 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
EGR1P18146 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGR1P18146 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGR1P18146 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGR1P18146 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGR1P18146 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EGR1P18146 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EGR1P18146 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EGR1P18146 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EGR1P18146 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EGR1P18146 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EGR1P18146 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EGR1P18146 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EGR1P18146 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EGR1P18146 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EGR1P18146 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EGR1P18146 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EGR1P18146 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EGR1P18146 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EGR1P18146 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EGR1P18146 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EGR1P18146 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EGR1P18146 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EGR1P18146 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EGR1P18146 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EGR1P18146 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EGR1P18146 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EGR1P18146 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EGR1P18146 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
EGR1P18146 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
EGR1P18146 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EGR1P18146 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EGR1P18146 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EGR1P18146 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EGR1P18146 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EGR1P18146 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EGR1P18146 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EGR1P18146 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EGR1P18146 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EGR1P18146 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EGR1P18146 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EGR1P18146 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EGR1P18146 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EGR1P18146 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EGR1P18146 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EGR1P18146 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EGR1P18146 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms