Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTPS1P17812 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms