Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms