Protein–RNA interactions for Protein: P15374

UCHL3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UCHL3P15374 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
UCHL3P15374 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UCHL3P15374 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UCHL3P15374 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UCHL3P15374 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UCHL3P15374 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UCHL3P15374 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UCHL3P15374 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UCHL3P15374 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UCHL3P15374 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UCHL3P15374 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UCHL3P15374 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UCHL3P15374 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UCHL3P15374 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
UCHL3P15374 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UCHL3P15374 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UCHL3P15374 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UCHL3P15374 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UCHL3P15374 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UCHL3P15374 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UCHL3P15374 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UCHL3P15374 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UCHL3P15374 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UCHL3P15374 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UCHL3P15374 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UCHL3P15374 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UCHL3P15374 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UCHL3P15374 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UCHL3P15374 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UCHL3P15374 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UCHL3P15374 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UCHL3P15374 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UCHL3P15374 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UCHL3P15374 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UCHL3P15374 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UCHL3P15374 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UCHL3P15374 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UCHL3P15374 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UCHL3P15374 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UCHL3P15374 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UCHL3P15374 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UCHL3P15374 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UCHL3P15374 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UCHL3P15374 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UCHL3P15374 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
UCHL3P15374 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UCHL3P15374 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UCHL3P15374 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UCHL3P15374 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UCHL3P15374 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UCHL3P15374 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UCHL3P15374 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UCHL3P15374 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UCHL3P15374 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UCHL3P15374 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UCHL3P15374 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UCHL3P15374 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
UCHL3P15374 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
UCHL3P15374 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
UCHL3P15374 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms