Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
RGPD2P0DJD1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RGPD2P0DJD1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RGPD2P0DJD1 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
RGPD2P0DJD1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RGPD2P0DJD1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RGPD2P0DJD1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RGPD2P0DJD1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
RGPD2P0DJD1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
RGPD2P0DJD1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RGPD2P0DJD1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RGPD2P0DJD1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RGPD2P0DJD1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RGPD2P0DJD1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RGPD2P0DJD1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RGPD2P0DJD1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RGPD2P0DJD1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RGPD2P0DJD1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
RGPD2P0DJD1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RGPD2P0DJD1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RGPD2P0DJD1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RGPD2P0DJD1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RGPD2P0DJD1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RGPD2P0DJD1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RGPD2P0DJD1 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RGPD2P0DJD1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RGPD2P0DJD1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RGPD2P0DJD1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RGPD2P0DJD1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RGPD2P0DJD1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RGPD2P0DJD1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RGPD2P0DJD1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RGPD2P0DJD1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RGPD2P0DJD1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RGPD2P0DJD1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RGPD2P0DJD1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RGPD2P0DJD1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
RGPD2P0DJD1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RGPD2P0DJD1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
RGPD2P0DJD1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RGPD2P0DJD1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
RGPD2P0DJD1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
RGPD2P0DJD1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RGPD2P0DJD1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RGPD2P0DJD1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RGPD2P0DJD1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RGPD2P0DJD1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RGPD2P0DJD1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RGPD2P0DJD1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RGPD2P0DJD1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RGPD2P0DJD1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RGPD2P0DJD1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RGPD2P0DJD1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RGPD2P0DJD1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RGPD2P0DJD1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RGPD2P0DJD1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RGPD2P0DJD1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RGPD2P0DJD1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RGPD2P0DJD1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RGPD2P0DJD1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RGPD2P0DJD1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RGPD2P0DJD1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RGPD2P0DJD1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RGPD2P0DJD1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RGPD2P0DJD1 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RGPD2P0DJD1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RGPD2P0DJD1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RGPD2P0DJD1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RGPD2P0DJD1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RGPD2P0DJD1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RGPD2P0DJD1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RGPD2P0DJD1 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RGPD2P0DJD1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RGPD2P0DJD1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RGPD2P0DJD1 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RGPD2P0DJD1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
RGPD2P0DJD1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RGPD2P0DJD1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RGPD2P0DJD1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RGPD2P0DJD1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RGPD2P0DJD1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RGPD2P0DJD1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RGPD2P0DJD1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RGPD2P0DJD1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RGPD2P0DJD1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RGPD2P0DJD1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RGPD2P0DJD1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
RGPD2P0DJD1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RGPD2P0DJD1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RGPD2P0DJD1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RGPD2P0DJD1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RGPD2P0DJD1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RGPD2P0DJD1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RGPD2P0DJD1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
RGPD2P0DJD1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
RGPD2P0DJD1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
RGPD2P0DJD1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RGPD2P0DJD1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RGPD2P0DJD1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RGPD2P0DJD1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms