Protein–RNA interactions for Protein: P0CAP2

POLR2M, DNA-directed RNA polymerase II subunit GRINL1A, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2MP0CAP2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR2MP0CAP2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR2MP0CAP2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR2MP0CAP2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR2MP0CAP2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR2MP0CAP2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR2MP0CAP2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR2MP0CAP2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR2MP0CAP2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR2MP0CAP2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR2MP0CAP2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR2MP0CAP2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR2MP0CAP2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR2MP0CAP2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR2MP0CAP2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR2MP0CAP2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR2MP0CAP2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR2MP0CAP2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR2MP0CAP2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR2MP0CAP2 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR2MP0CAP2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR2MP0CAP2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR2MP0CAP2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR2MP0CAP2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR2MP0CAP2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR2MP0CAP2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR2MP0CAP2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR2MP0CAP2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR2MP0CAP2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR2MP0CAP2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR2MP0CAP2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR2MP0CAP2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR2MP0CAP2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR2MP0CAP2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR2MP0CAP2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR2MP0CAP2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR2MP0CAP2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR2MP0CAP2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR2MP0CAP2 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR2MP0CAP2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR2MP0CAP2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR2MP0CAP2 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR2MP0CAP2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR2MP0CAP2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR2MP0CAP2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR2MP0CAP2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR2MP0CAP2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR2MP0CAP2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR2MP0CAP2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR2MP0CAP2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR2MP0CAP2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR2MP0CAP2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR2MP0CAP2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR2MP0CAP2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR2MP0CAP2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR2MP0CAP2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR2MP0CAP2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR2MP0CAP2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms