Protein–RNA interactions for Protein: P0C7H9

USP17L7, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L7P0C7H9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L7P0C7H9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L7P0C7H9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L7P0C7H9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L7P0C7H9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L7P0C7H9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L7P0C7H9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L7P0C7H9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L7P0C7H9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L7P0C7H9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L7P0C7H9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L7P0C7H9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L7P0C7H9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L7P0C7H9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L7P0C7H9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L7P0C7H9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L7P0C7H9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L7P0C7H9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L7P0C7H9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L7P0C7H9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L7P0C7H9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L7P0C7H9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L7P0C7H9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L7P0C7H9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L7P0C7H9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L7P0C7H9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L7P0C7H9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L7P0C7H9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L7P0C7H9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L7P0C7H9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L7P0C7H9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L7P0C7H9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L7P0C7H9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L7P0C7H9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L7P0C7H9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L7P0C7H9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L7P0C7H9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L7P0C7H9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L7P0C7H9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L7P0C7H9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L7P0C7H9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L7P0C7H9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L7P0C7H9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L7P0C7H9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L7P0C7H9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L7P0C7H9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L7P0C7H9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L7P0C7H9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L7P0C7H9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L7P0C7H9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP17L7P0C7H9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP17L7P0C7H9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP17L7P0C7H9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP17L7P0C7H9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP17L7P0C7H9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP17L7P0C7H9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L7P0C7H9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms