Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CENPBP07199 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CENPBP07199 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CENPBP07199 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CENPBP07199 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CENPBP07199 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CENPBP07199 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CENPBP07199 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CENPBP07199 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CENPBP07199 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CENPBP07199 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CENPBP07199 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CENPBP07199 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CENPBP07199 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CENPBP07199 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CENPBP07199 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CENPBP07199 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CENPBP07199 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CENPBP07199 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CENPBP07199 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CENPBP07199 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CENPBP07199 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CENPBP07199 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CENPBP07199 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CENPBP07199 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CENPBP07199 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CENPBP07199 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CENPBP07199 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CENPBP07199 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CENPBP07199 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CENPBP07199 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CENPBP07199 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CENPBP07199 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CENPBP07199 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CENPBP07199 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CENPBP07199 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CENPBP07199 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CENPBP07199 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CENPBP07199 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CENPBP07199 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CENPBP07199 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CENPBP07199 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CENPBP07199 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CENPBP07199 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CENPBP07199 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CENPBP07199 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CENPBP07199 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CENPBP07199 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CENPBP07199 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CENPBP07199 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CENPBP07199 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CENPBP07199 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CENPBP07199 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CENPBP07199 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CENPBP07199 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CENPBP07199 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CENPBP07199 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CENPBP07199 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CENPBP07199 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CENPBP07199 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CENPBP07199 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CENPBP07199 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CENPBP07199 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CENPBP07199 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CENPBP07199 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CENPBP07199 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CENPBP07199 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CENPBP07199 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CENPBP07199 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CENPBP07199 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CENPBP07199 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CENPBP07199 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CENPBP07199 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CENPBP07199 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CENPBP07199 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CENPBP07199 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CENPBP07199 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CENPBP07199 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CENPBP07199 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CENPBP07199 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CENPBP07199 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CENPBP07199 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CENPBP07199 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CENPBP07199 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CENPBP07199 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CENPBP07199 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CENPBP07199 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CENPBP07199 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CENPBP07199 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CENPBP07199 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CENPBP07199 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CENPBP07199 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CENPBP07199 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CENPBP07199 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CENPBP07199 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CENPBP07199 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CENPBP07199 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CENPBP07199 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CENPBP07199 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CENPBP07199 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms