Protein–RNA interactions for Protein: P06493

CDK1, Cyclin-dependent kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK1P06493 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK1P06493 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK1P06493 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK1P06493 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK1P06493 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK1P06493 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK1P06493 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK1P06493 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK1P06493 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK1P06493 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK1P06493 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK1P06493 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK1P06493 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK1P06493 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK1P06493 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK1P06493 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK1P06493 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK1P06493 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK1P06493 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK1P06493 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK1P06493 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK1P06493 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK1P06493 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK1P06493 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK1P06493 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK1P06493 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK1P06493 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK1P06493 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK1P06493 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK1P06493 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK1P06493 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK1P06493 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK1P06493 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK1P06493 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK1P06493 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK1P06493 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK1P06493 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK1P06493 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK1P06493 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK1P06493 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK1P06493 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK1P06493 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK1P06493 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK1P06493 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK1P06493 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK1P06493 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK1P06493 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK1P06493 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK1P06493 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK1P06493 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK1P06493 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK1P06493 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK1P06493 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK1P06493 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK1P06493 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK1P06493 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK1P06493 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK1P06493 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK1P06493 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK1P06493 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK1P06493 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK1P06493 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK1P06493 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK1P06493 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK1P06493 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK1P06493 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK1P06493 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK1P06493 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK1P06493 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK1P06493 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK1P06493 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK1P06493 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK1P06493 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK1P06493 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK1P06493 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK1P06493 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK1P06493 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK1P06493 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK1P06493 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK1P06493 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK1P06493 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK1P06493 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK1P06493 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK1P06493 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK1P06493 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK1P06493 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK1P06493 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK1P06493 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK1P06493 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK1P06493 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK1P06493 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK1P06493 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK1P06493 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK1P06493 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK1P06493 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK1P06493 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK1P06493 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK1P06493 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK1P06493 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK1P06493 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms