Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYBBP04839 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYBBP04839 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYBBP04839 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYBBP04839 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYBBP04839 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYBBP04839 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYBBP04839 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYBBP04839 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CYBBP04839 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYBBP04839 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYBBP04839 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYBBP04839 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CYBBP04839 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYBBP04839 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CYBBP04839 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYBBP04839 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYBBP04839 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYBBP04839 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYBBP04839 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYBBP04839 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYBBP04839 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYBBP04839 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYBBP04839 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYBBP04839 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYBBP04839 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYBBP04839 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYBBP04839 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYBBP04839 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYBBP04839 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYBBP04839 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYBBP04839 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYBBP04839 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYBBP04839 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYBBP04839 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYBBP04839 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYBBP04839 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYBBP04839 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYBBP04839 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYBBP04839 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYBBP04839 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CYBBP04839 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYBBP04839 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYBBP04839 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CYBBP04839 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYBBP04839 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYBBP04839 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYBBP04839 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYBBP04839 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CYBBP04839 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYBBP04839 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYBBP04839 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYBBP04839 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYBBP04839 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYBBP04839 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYBBP04839 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYBBP04839 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYBBP04839 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYBBP04839 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYBBP04839 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYBBP04839 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CYBBP04839 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYBBP04839 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CYBBP04839 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CYBBP04839 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CYBBP04839 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CYBBP04839 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CYBBP04839 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CYBBP04839 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CYBBP04839 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CYBBP04839 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CYBBP04839 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CYBBP04839 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CYBBP04839 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CYBBP04839 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CYBBP04839 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CYBBP04839 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CYBBP04839 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYBBP04839 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYBBP04839 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYBBP04839 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYBBP04839 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYBBP04839 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYBBP04839 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CYBBP04839 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CYBBP04839 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYBBP04839 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CYBBP04839 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYBBP04839 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CYBBP04839 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYBBP04839 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYBBP04839 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYBBP04839 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYBBP04839 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYBBP04839 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CYBBP04839 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CYBBP04839 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CYBBP04839 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CYBBP04839 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CYBBP04839 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms