Protein–RNA interactions for Protein: P02649

APOE, Apolipoprotein E, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOEP02649 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOEP02649 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOEP02649 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
APOEP02649 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOEP02649 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOEP02649 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
APOEP02649 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
APOEP02649 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
APOEP02649 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
APOEP02649 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
APOEP02649 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
APOEP02649 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOEP02649 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOEP02649 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOEP02649 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOEP02649 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOEP02649 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOEP02649 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOEP02649 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOEP02649 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOEP02649 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOEP02649 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOEP02649 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOEP02649 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOEP02649 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOEP02649 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOEP02649 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOEP02649 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOEP02649 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOEP02649 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOEP02649 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOEP02649 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOEP02649 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOEP02649 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOEP02649 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOEP02649 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOEP02649 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOEP02649 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOEP02649 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOEP02649 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOEP02649 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOEP02649 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOEP02649 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOEP02649 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOEP02649 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOEP02649 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOEP02649 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOEP02649 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOEP02649 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOEP02649 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOEP02649 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOEP02649 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOEP02649 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOEP02649 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOEP02649 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOEP02649 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOEP02649 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOEP02649 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOEP02649 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOEP02649 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
APOEP02649 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOEP02649 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOEP02649 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOEP02649 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOEP02649 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOEP02649 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOEP02649 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOEP02649 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOEP02649 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOEP02649 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOEP02649 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOEP02649 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOEP02649 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOEP02649 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOEP02649 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOEP02649 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOEP02649 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOEP02649 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOEP02649 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOEP02649 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOEP02649 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOEP02649 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOEP02649 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOEP02649 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOEP02649 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOEP02649 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOEP02649 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
APOEP02649 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOEP02649 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
APOEP02649 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOEP02649 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOEP02649 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
APOEP02649 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOEP02649 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOEP02649 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOEP02649 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOEP02649 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOEP02649 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOEP02649 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOEP02649 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms