Protein–RNA interactions for Protein: P01033

TIMP1, Metalloproteinase inhibitor 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMP1P01033 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TIMP1P01033 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TIMP1P01033 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TIMP1P01033 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TIMP1P01033 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TIMP1P01033 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TIMP1P01033 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TIMP1P01033 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TIMP1P01033 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TIMP1P01033 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TIMP1P01033 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TIMP1P01033 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TIMP1P01033 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TIMP1P01033 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TIMP1P01033 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TIMP1P01033 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TIMP1P01033 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TIMP1P01033 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TIMP1P01033 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TIMP1P01033 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TIMP1P01033 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TIMP1P01033 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TIMP1P01033 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TIMP1P01033 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TIMP1P01033 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TIMP1P01033 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TIMP1P01033 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TIMP1P01033 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TIMP1P01033 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TIMP1P01033 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TIMP1P01033 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TIMP1P01033 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TIMP1P01033 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TIMP1P01033 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TIMP1P01033 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TIMP1P01033 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TIMP1P01033 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TIMP1P01033 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TIMP1P01033 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TIMP1P01033 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TIMP1P01033 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TIMP1P01033 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TIMP1P01033 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TIMP1P01033 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TIMP1P01033 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TIMP1P01033 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TIMP1P01033 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TIMP1P01033 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TIMP1P01033 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TIMP1P01033 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TIMP1P01033 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TIMP1P01033 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TIMP1P01033 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TIMP1P01033 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TIMP1P01033 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TIMP1P01033 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TIMP1P01033 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TIMP1P01033 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TIMP1P01033 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TIMP1P01033 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TIMP1P01033 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TIMP1P01033 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TIMP1P01033 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TIMP1P01033 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TIMP1P01033 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TIMP1P01033 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TIMP1P01033 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TIMP1P01033 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TIMP1P01033 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TIMP1P01033 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
TIMP1P01033 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TIMP1P01033 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TIMP1P01033 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TIMP1P01033 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TIMP1P01033 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TIMP1P01033 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TIMP1P01033 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TIMP1P01033 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TIMP1P01033 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TIMP1P01033 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TIMP1P01033 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TIMP1P01033 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TIMP1P01033 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TIMP1P01033 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TIMP1P01033 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TIMP1P01033 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TIMP1P01033 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TIMP1P01033 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TIMP1P01033 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TIMP1P01033 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TIMP1P01033 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TIMP1P01033 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TIMP1P01033 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TIMP1P01033 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TIMP1P01033 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TIMP1P01033 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TIMP1P01033 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TIMP1P01033 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TIMP1P01033 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TIMP1P01033 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms