Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NSD2O96028 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NSD2O96028 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NSD2O96028 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NSD2O96028 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NSD2O96028 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NSD2O96028 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NSD2O96028 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NSD2O96028 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NSD2O96028 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NSD2O96028 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
NSD2O96028 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NSD2O96028 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NSD2O96028 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NSD2O96028 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NSD2O96028 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
NSD2O96028 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NSD2O96028 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NSD2O96028 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NSD2O96028 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NSD2O96028 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NSD2O96028 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NSD2O96028 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NSD2O96028 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NSD2O96028 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NSD2O96028 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NSD2O96028 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NSD2O96028 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NSD2O96028 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NSD2O96028 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NSD2O96028 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NSD2O96028 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NSD2O96028 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NSD2O96028 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NSD2O96028 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NSD2O96028 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NSD2O96028 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NSD2O96028 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NSD2O96028 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NSD2O96028 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
NSD2O96028 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NSD2O96028 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NSD2O96028 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NSD2O96028 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NSD2O96028 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NSD2O96028 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
NSD2O96028 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
NSD2O96028 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
NSD2O96028 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NSD2O96028 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NSD2O96028 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NSD2O96028 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NSD2O96028 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NSD2O96028 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NSD2O96028 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NSD2O96028 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NSD2O96028 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NSD2O96028 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
NSD2O96028 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NSD2O96028 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NSD2O96028 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NSD2O96028 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NSD2O96028 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NSD2O96028 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NSD2O96028 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
NSD2O96028 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NSD2O96028 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NSD2O96028 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NSD2O96028 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NSD2O96028 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NSD2O96028 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NSD2O96028 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NSD2O96028 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
NSD2O96028 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NSD2O96028 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NSD2O96028 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NSD2O96028 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NSD2O96028 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NSD2O96028 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NSD2O96028 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NSD2O96028 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NSD2O96028 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NSD2O96028 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NSD2O96028 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NSD2O96028 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NSD2O96028 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NSD2O96028 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NSD2O96028 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NSD2O96028 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NSD2O96028 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NSD2O96028 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NSD2O96028 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NSD2O96028 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NSD2O96028 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NSD2O96028 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NSD2O96028 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NSD2O96028 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NSD2O96028 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NSD2O96028 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NSD2O96028 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms