Protein–RNA interactions for Protein: O95985

TOP3B, DNA topoisomerase 3-beta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BO95985 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TOP3BO95985 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TOP3BO95985 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TOP3BO95985 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TOP3BO95985 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TOP3BO95985 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TOP3BO95985 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TOP3BO95985 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TOP3BO95985 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TOP3BO95985 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TOP3BO95985 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TOP3BO95985 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TOP3BO95985 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TOP3BO95985 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TOP3BO95985 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TOP3BO95985 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TOP3BO95985 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TOP3BO95985 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TOP3BO95985 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TOP3BO95985 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TOP3BO95985 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TOP3BO95985 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TOP3BO95985 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TOP3BO95985 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TOP3BO95985 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TOP3BO95985 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TOP3BO95985 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TOP3BO95985 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TOP3BO95985 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TOP3BO95985 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TOP3BO95985 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TOP3BO95985 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TOP3BO95985 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TOP3BO95985 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TOP3BO95985 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TOP3BO95985 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TOP3BO95985 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TOP3BO95985 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TOP3BO95985 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TOP3BO95985 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TOP3BO95985 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TOP3BO95985 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TOP3BO95985 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TOP3BO95985 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TOP3BO95985 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TOP3BO95985 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TOP3BO95985 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TOP3BO95985 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TOP3BO95985 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TOP3BO95985 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TOP3BO95985 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TOP3BO95985 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TOP3BO95985 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TOP3BO95985 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TOP3BO95985 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TOP3BO95985 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TOP3BO95985 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TOP3BO95985 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TOP3BO95985 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TOP3BO95985 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TOP3BO95985 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TOP3BO95985 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TOP3BO95985 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TOP3BO95985 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TOP3BO95985 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TOP3BO95985 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TOP3BO95985 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TOP3BO95985 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TOP3BO95985 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TOP3BO95985 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TOP3BO95985 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TOP3BO95985 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TOP3BO95985 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TOP3BO95985 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TOP3BO95985 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TOP3BO95985 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TOP3BO95985 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TOP3BO95985 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TOP3BO95985 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TOP3BO95985 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TOP3BO95985 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TOP3BO95985 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TOP3BO95985 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TOP3BO95985 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TOP3BO95985 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TOP3BO95985 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TOP3BO95985 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TOP3BO95985 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TOP3BO95985 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TOP3BO95985 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TOP3BO95985 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TOP3BO95985 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TOP3BO95985 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TOP3BO95985 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TOP3BO95985 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TOP3BO95985 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TOP3BO95985 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TOP3BO95985 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TOP3BO95985 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TOP3BO95985 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms