Protein–RNA interactions for Protein: O95522

PRAMEF12, PRAME family member 12, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF12O95522 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF12O95522 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF12O95522 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF12O95522 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF12O95522 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF12O95522 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF12O95522 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF12O95522 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF12O95522 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF12O95522 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF12O95522 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF12O95522 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF12O95522 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF12O95522 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF12O95522 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF12O95522 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF12O95522 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF12O95522 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF12O95522 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF12O95522 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF12O95522 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF12O95522 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF12O95522 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF12O95522 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF12O95522 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF12O95522 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF12O95522 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF12O95522 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF12O95522 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF12O95522 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF12O95522 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF12O95522 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF12O95522 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF12O95522 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF12O95522 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF12O95522 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF12O95522 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF12O95522 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF12O95522 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF12O95522 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms