Protein–RNA interactions for Protein: O95473

SYNGR4, Synaptogyrin-4, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR4O95473 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYNGR4O95473 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms