Protein–RNA interactions for Protein: O95342

ABCB11, Bile salt export pump, humanhuman

Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB11O95342 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABCB11O95342 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABCB11O95342 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABCB11O95342 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ABCB11O95342 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABCB11O95342 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABCB11O95342 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABCB11O95342 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ABCB11O95342 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABCB11O95342 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABCB11O95342 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABCB11O95342 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABCB11O95342 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABCB11O95342 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCB11O95342 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCB11O95342 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCB11O95342 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCB11O95342 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCB11O95342 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCB11O95342 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCB11O95342 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCB11O95342 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCB11O95342 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCB11O95342 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCB11O95342 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCB11O95342 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCB11O95342 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCB11O95342 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCB11O95342 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCB11O95342 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCB11O95342 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCB11O95342 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCB11O95342 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCB11O95342 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCB11O95342 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCB11O95342 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCB11O95342 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCB11O95342 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCB11O95342 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCB11O95342 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCB11O95342 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCB11O95342 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCB11O95342 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCB11O95342 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCB11O95342 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCB11O95342 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCB11O95342 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCB11O95342 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCB11O95342 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCB11O95342 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCB11O95342 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCB11O95342 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCB11O95342 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCB11O95342 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCB11O95342 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCB11O95342 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCB11O95342 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCB11O95342 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCB11O95342 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCB11O95342 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCB11O95342 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCB11O95342 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCB11O95342 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCB11O95342 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCB11O95342 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCB11O95342 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCB11O95342 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCB11O95342 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCB11O95342 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCB11O95342 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCB11O95342 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCB11O95342 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCB11O95342 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCB11O95342 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCB11O95342 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCB11O95342 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCB11O95342 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCB11O95342 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCB11O95342 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ABCB11O95342 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ABCB11O95342 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
ABCB11O95342 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ABCB11O95342 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ABCB11O95342 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ABCB11O95342 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ABCB11O95342 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ABCB11O95342 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ABCB11O95342 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ABCB11O95342 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ABCB11O95342 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ABCB11O95342 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ABCB11O95342 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCB11O95342 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCB11O95342 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCB11O95342 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCB11O95342 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCB11O95342 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCB11O95342 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCB11O95342 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCB11O95342 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms