Protein–RNA interactions for Protein: O75607

NPM3, Nucleoplasmin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM3O75607 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NPM3O75607 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NPM3O75607 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NPM3O75607 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NPM3O75607 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NPM3O75607 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NPM3O75607 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NPM3O75607 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NPM3O75607 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NPM3O75607 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NPM3O75607 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NPM3O75607 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NPM3O75607 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NPM3O75607 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NPM3O75607 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NPM3O75607 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NPM3O75607 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NPM3O75607 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NPM3O75607 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NPM3O75607 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NPM3O75607 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NPM3O75607 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NPM3O75607 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NPM3O75607 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NPM3O75607 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NPM3O75607 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NPM3O75607 AC007688.1-201ENST00000475592 759 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NPM3O75607 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NPM3O75607 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NPM3O75607 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NPM3O75607 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NPM3O75607 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NPM3O75607 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NPM3O75607 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NPM3O75607 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NPM3O75607 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NPM3O75607 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NPM3O75607 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NPM3O75607 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NPM3O75607 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NPM3O75607 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NPM3O75607 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NPM3O75607 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NPM3O75607 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NPM3O75607 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NPM3O75607 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NPM3O75607 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NPM3O75607 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NPM3O75607 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NPM3O75607 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NPM3O75607 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NPM3O75607 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NPM3O75607 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NPM3O75607 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NPM3O75607 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NPM3O75607 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NPM3O75607 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NPM3O75607 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NPM3O75607 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NPM3O75607 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NPM3O75607 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NPM3O75607 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NPM3O75607 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NPM3O75607 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NPM3O75607 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NPM3O75607 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NPM3O75607 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NPM3O75607 ACTG1P22-201ENST00000603793 1099 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NPM3O75607 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NPM3O75607 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NPM3O75607 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NPM3O75607 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NPM3O75607 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NPM3O75607 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NPM3O75607 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NPM3O75607 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NPM3O75607 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NPM3O75607 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NPM3O75607 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NPM3O75607 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NPM3O75607 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NPM3O75607 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NPM3O75607 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NPM3O75607 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NPM3O75607 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NPM3O75607 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NPM3O75607 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NPM3O75607 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NPM3O75607 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NPM3O75607 AC092131.1-201ENST00000564046 548 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NPM3O75607 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NPM3O75607 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NPM3O75607 CBR3-AS1-213ENST00000623647 815 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NPM3O75607 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NPM3O75607 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NPM3O75607 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NPM3O75607 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NPM3O75607 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NPM3O75607 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NPM3O75607 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms