Protein–RNA interactions for Protein: O75508

CLDN11, Claudin-11, humanhuman

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11O75508 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN11O75508 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN11O75508 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN11O75508 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN11O75508 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN11O75508 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN11O75508 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN11O75508 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN11O75508 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN11O75508 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN11O75508 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN11O75508 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN11O75508 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN11O75508 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN11O75508 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN11O75508 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN11O75508 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN11O75508 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN11O75508 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN11O75508 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN11O75508 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN11O75508 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN11O75508 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN11O75508 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN11O75508 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN11O75508 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN11O75508 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN11O75508 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN11O75508 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN11O75508 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN11O75508 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN11O75508 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN11O75508 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN11O75508 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN11O75508 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN11O75508 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN11O75508 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN11O75508 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN11O75508 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN11O75508 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN11O75508 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN11O75508 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN11O75508 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN11O75508 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN11O75508 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN11O75508 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN11O75508 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN11O75508 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN11O75508 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CLDN11O75508 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDN11O75508 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDN11O75508 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDN11O75508 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDN11O75508 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDN11O75508 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDN11O75508 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDN11O75508 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
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CLDN11O75508 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDN11O75508 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDN11O75508 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDN11O75508 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDN11O75508 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDN11O75508 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDN11O75508 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDN11O75508 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDN11O75508 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDN11O75508 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDN11O75508 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDN11O75508 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDN11O75508 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN11O75508 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN11O75508 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
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CLDN11O75508 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN11O75508 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN11O75508 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN11O75508 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN11O75508 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN11O75508 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN11O75508 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN11O75508 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN11O75508 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN11O75508 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN11O75508 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDN11O75508 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDN11O75508 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDN11O75508 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDN11O75508 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDN11O75508 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDN11O75508 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDN11O75508 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDN11O75508 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDN11O75508 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDN11O75508 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDN11O75508 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDN11O75508 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDN11O75508 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDN11O75508 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDN11O75508 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
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