Protein–RNA interactions for Protein: O75150

RNF40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF40O75150 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF40O75150 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF40O75150 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF40O75150 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF40O75150 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF40O75150 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF40O75150 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF40O75150 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF40O75150 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF40O75150 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF40O75150 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF40O75150 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF40O75150 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF40O75150 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF40O75150 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF40O75150 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF40O75150 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF40O75150 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF40O75150 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF40O75150 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF40O75150 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF40O75150 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF40O75150 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF40O75150 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF40O75150 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF40O75150 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF40O75150 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF40O75150 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF40O75150 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF40O75150 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF40O75150 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF40O75150 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF40O75150 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF40O75150 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF40O75150 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF40O75150 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF40O75150 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF40O75150 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF40O75150 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF40O75150 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF40O75150 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF40O75150 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF40O75150 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF40O75150 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF40O75150 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF40O75150 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF40O75150 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF40O75150 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF40O75150 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF40O75150 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF40O75150 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF40O75150 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF40O75150 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF40O75150 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF40O75150 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF40O75150 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF40O75150 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF40O75150 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF40O75150 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF40O75150 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF40O75150 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF40O75150 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF40O75150 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF40O75150 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF40O75150 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF40O75150 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF40O75150 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF40O75150 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF40O75150 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF40O75150 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF40O75150 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF40O75150 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF40O75150 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF40O75150 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF40O75150 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF40O75150 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF40O75150 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF40O75150 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF40O75150 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF40O75150 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF40O75150 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF40O75150 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF40O75150 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF40O75150 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF40O75150 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF40O75150 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF40O75150 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF40O75150 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF40O75150 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF40O75150 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF40O75150 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF40O75150 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF40O75150 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF40O75150 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF40O75150 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RNF40O75150 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF40O75150 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF40O75150 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF40O75150 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF40O75150 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms