Protein–RNA interactions for Protein: O60359

CACNG3, Voltage-dependent calcium channel gamma-3 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG3O60359 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNG3O60359 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNG3O60359 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNG3O60359 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNG3O60359 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNG3O60359 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNG3O60359 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNG3O60359 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNG3O60359 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNG3O60359 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNG3O60359 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNG3O60359 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNG3O60359 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNG3O60359 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNG3O60359 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNG3O60359 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNG3O60359 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNG3O60359 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNG3O60359 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNG3O60359 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNG3O60359 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNG3O60359 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNG3O60359 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNG3O60359 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNG3O60359 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNG3O60359 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNG3O60359 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNG3O60359 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNG3O60359 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNG3O60359 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNG3O60359 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNG3O60359 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNG3O60359 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNG3O60359 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNG3O60359 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNG3O60359 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNG3O60359 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNG3O60359 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNG3O60359 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CACNG3O60359 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CACNG3O60359 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNG3O60359 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNG3O60359 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNG3O60359 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNG3O60359 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNG3O60359 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNG3O60359 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNG3O60359 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNG3O60359 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNG3O60359 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNG3O60359 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNG3O60359 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNG3O60359 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNG3O60359 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNG3O60359 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNG3O60359 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNG3O60359 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNG3O60359 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNG3O60359 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNG3O60359 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNG3O60359 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CACNG3O60359 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNG3O60359 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CACNG3O60359 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CACNG3O60359 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNG3O60359 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CACNG3O60359 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNG3O60359 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNG3O60359 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNG3O60359 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNG3O60359 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNG3O60359 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNG3O60359 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNG3O60359 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNG3O60359 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNG3O60359 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNG3O60359 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNG3O60359 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNG3O60359 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNG3O60359 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNG3O60359 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNG3O60359 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNG3O60359 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNG3O60359 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNG3O60359 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNG3O60359 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNG3O60359 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNG3O60359 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNG3O60359 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNG3O60359 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNG3O60359 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNG3O60359 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNG3O60359 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNG3O60359 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNG3O60359 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNG3O60359 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNG3O60359 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNG3O60359 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNG3O60359 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNG3O60359 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.3 ms