Protein–RNA interactions for Protein: O43252

PAPSS1, Bifunctional 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate synthase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPSS1O43252 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PAPSS1O43252 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PAPSS1O43252 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PAPSS1O43252 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PAPSS1O43252 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAPSS1O43252 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAPSS1O43252 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAPSS1O43252 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAPSS1O43252 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAPSS1O43252 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAPSS1O43252 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAPSS1O43252 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAPSS1O43252 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAPSS1O43252 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAPSS1O43252 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAPSS1O43252 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAPSS1O43252 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAPSS1O43252 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAPSS1O43252 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAPSS1O43252 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAPSS1O43252 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAPSS1O43252 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAPSS1O43252 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAPSS1O43252 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAPSS1O43252 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAPSS1O43252 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAPSS1O43252 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAPSS1O43252 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms