Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRXO43186 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRXO43186 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRXO43186 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRXO43186 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRXO43186 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRXO43186 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRXO43186 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRXO43186 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRXO43186 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRXO43186 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRXO43186 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRXO43186 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRXO43186 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRXO43186 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CRXO43186 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRXO43186 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRXO43186 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRXO43186 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRXO43186 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRXO43186 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRXO43186 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRXO43186 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRXO43186 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRXO43186 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRXO43186 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRXO43186 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRXO43186 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRXO43186 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRXO43186 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRXO43186 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRXO43186 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRXO43186 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRXO43186 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CRXO43186 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CRXO43186 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRXO43186 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRXO43186 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRXO43186 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRXO43186 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRXO43186 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRXO43186 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRXO43186 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRXO43186 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRXO43186 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRXO43186 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRXO43186 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CRXO43186 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRXO43186 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRXO43186 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRXO43186 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRXO43186 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRXO43186 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRXO43186 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRXO43186 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRXO43186 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRXO43186 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRXO43186 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRXO43186 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRXO43186 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRXO43186 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRXO43186 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CRXO43186 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRXO43186 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRXO43186 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CRXO43186 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRXO43186 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRXO43186 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRXO43186 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRXO43186 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRXO43186 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRXO43186 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRXO43186 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRXO43186 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRXO43186 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRXO43186 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRXO43186 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRXO43186 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRXO43186 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRXO43186 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRXO43186 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRXO43186 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRXO43186 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRXO43186 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRXO43186 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRXO43186 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRXO43186 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRXO43186 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRXO43186 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRXO43186 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CRXO43186 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CRXO43186 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CRXO43186 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CRXO43186 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRXO43186 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRXO43186 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRXO43186 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRXO43186 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRXO43186 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRXO43186 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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