Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NDUFS4O43181 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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