Protein–RNA interactions for Protein: O15524

SOCS1, Suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1O15524 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms