Protein–RNA interactions for Protein: O00294

TULP1, Tubby-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP1O00294 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TULP1O00294 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TULP1O00294 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TULP1O00294 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TULP1O00294 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TULP1O00294 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TULP1O00294 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TULP1O00294 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TULP1O00294 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TULP1O00294 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TULP1O00294 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TULP1O00294 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TULP1O00294 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TULP1O00294 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TULP1O00294 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TULP1O00294 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TULP1O00294 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TULP1O00294 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TULP1O00294 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TULP1O00294 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TULP1O00294 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TULP1O00294 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TULP1O00294 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TULP1O00294 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TULP1O00294 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TULP1O00294 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TULP1O00294 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TULP1O00294 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TULP1O00294 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TULP1O00294 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TULP1O00294 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TULP1O00294 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TULP1O00294 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TULP1O00294 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TULP1O00294 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TULP1O00294 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TULP1O00294 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TULP1O00294 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TULP1O00294 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TULP1O00294 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TULP1O00294 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TULP1O00294 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TULP1O00294 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TULP1O00294 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TULP1O00294 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TULP1O00294 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TULP1O00294 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TULP1O00294 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TULP1O00294 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TULP1O00294 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TULP1O00294 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TULP1O00294 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TULP1O00294 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TULP1O00294 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TULP1O00294 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TULP1O00294 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TULP1O00294 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TULP1O00294 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TULP1O00294 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TULP1O00294 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TULP1O00294 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TULP1O00294 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TULP1O00294 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TULP1O00294 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TULP1O00294 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TULP1O00294 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TULP1O00294 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TULP1O00294 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TULP1O00294 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TULP1O00294 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TULP1O00294 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TULP1O00294 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TULP1O00294 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TULP1O00294 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TULP1O00294 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TULP1O00294 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TULP1O00294 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TULP1O00294 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TULP1O00294 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TULP1O00294 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TULP1O00294 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TULP1O00294 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TULP1O00294 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TULP1O00294 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TULP1O00294 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TULP1O00294 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TULP1O00294 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TULP1O00294 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TULP1O00294 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TULP1O00294 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TULP1O00294 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TULP1O00294 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TULP1O00294 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TULP1O00294 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TULP1O00294 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TULP1O00294 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TULP1O00294 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TULP1O00294 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TULP1O00294 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TULP1O00294 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms