Protein–RNA interactions for Protein: J3KR12

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KR12 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
J3KR12 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
J3KR12 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
J3KR12 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
J3KR12 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
J3KR12 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
J3KR12 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
J3KR12 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
J3KR12 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
J3KR12 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
J3KR12 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
J3KR12 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
J3KR12 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
J3KR12 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
J3KR12 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
J3KR12 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
J3KR12 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
J3KR12 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
J3KR12 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
J3KR12 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
J3KR12 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
J3KR12 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
J3KR12 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
J3KR12 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
J3KR12 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
J3KR12 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
J3KR12 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
J3KR12 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
J3KR12 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
J3KR12 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
J3KR12 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
J3KR12 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
J3KR12 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
J3KR12 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
J3KR12 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
J3KR12 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
J3KR12 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
J3KR12 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
J3KR12 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
J3KR12 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
J3KR12 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
J3KR12 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
J3KR12 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
J3KR12 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
J3KR12 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
J3KR12 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
J3KR12 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
J3KR12 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
J3KR12 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
J3KR12 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
J3KR12 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
J3KR12 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
J3KR12 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
J3KR12 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
J3KR12 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
J3KR12 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
J3KR12 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
J3KR12 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
J3KR12 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
J3KR12 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
J3KR12 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
J3KR12 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
J3KR12 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
J3KR12 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
J3KR12 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
J3KR12 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
J3KR12 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
J3KR12 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
J3KR12 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
J3KR12 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
J3KR12 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
J3KR12 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
J3KR12 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
J3KR12 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
J3KR12 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
J3KR12 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
J3KR12 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
J3KR12 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
J3KR12 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
J3KR12 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
J3KR12 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
J3KR12 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
J3KR12 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
J3KR12 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
J3KR12 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
J3KR12 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
J3KR12 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
J3KR12 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
J3KR12 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
J3KR12 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
J3KR12 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
J3KR12 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
J3KR12 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
J3KR12 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
J3KR12 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
J3KR12 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
J3KR12 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
J3KR12 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
J3KR12 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
J3KR12 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms