Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HHLA1C9JL84 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HHLA1C9JL84 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HHLA1C9JL84 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HHLA1C9JL84 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HHLA1C9JL84 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HHLA1C9JL84 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HHLA1C9JL84 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HHLA1C9JL84 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms