Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC169A6NNP5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC169A6NNP5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC169A6NNP5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC169A6NNP5 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC169A6NNP5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC169A6NNP5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC169A6NNP5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC169A6NNP5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC169A6NNP5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC169A6NNP5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC169A6NNP5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC169A6NNP5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC169A6NNP5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC169A6NNP5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC169A6NNP5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC169A6NNP5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC169A6NNP5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC169A6NNP5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC169A6NNP5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC169A6NNP5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC169A6NNP5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC169A6NNP5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC169A6NNP5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC169A6NNP5 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC169A6NNP5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC169A6NNP5 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC169A6NNP5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC169A6NNP5 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC169A6NNP5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC169A6NNP5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC169A6NNP5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC169A6NNP5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC169A6NNP5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC169A6NNP5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC169A6NNP5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC169A6NNP5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC169A6NNP5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC169A6NNP5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC169A6NNP5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC169A6NNP5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC169A6NNP5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC169A6NNP5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC169A6NNP5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC169A6NNP5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC169A6NNP5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC169A6NNP5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC169A6NNP5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC169A6NNP5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC169A6NNP5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC169A6NNP5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC169A6NNP5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC169A6NNP5 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC169A6NNP5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC169A6NNP5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC169A6NNP5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CCDC169A6NNP5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC169A6NNP5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC169A6NNP5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC169A6NNP5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC169A6NNP5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC169A6NNP5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC169A6NNP5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC169A6NNP5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC169A6NNP5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC169A6NNP5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC169A6NNP5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC169A6NNP5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC169A6NNP5 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC169A6NNP5 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC169A6NNP5 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC169A6NNP5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC169A6NNP5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC169A6NNP5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC169A6NNP5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC169A6NNP5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC169A6NNP5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC169A6NNP5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC169A6NNP5 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC169A6NNP5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC169A6NNP5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC169A6NNP5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC169A6NNP5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC169A6NNP5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC169A6NNP5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC169A6NNP5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC169A6NNP5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC169A6NNP5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC169A6NNP5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC169A6NNP5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC169A6NNP5 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC169A6NNP5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC169A6NNP5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC169A6NNP5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC169A6NNP5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC169A6NNP5 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC169A6NNP5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC169A6NNP5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC169A6NNP5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC169A6NNP5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms