Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQF3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A0U1RQF3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms