Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 ASAH1-215ENST00000635769 575 ntTSL 417.89■□□□□ 0.451e-6■■■■■ 43.9
UTP3Q9NQZ2 ASAH1-252ENST00000637603 579 ntTSL 417.89■□□□□ 0.451e-6■■■■■ 43.9
UTP3Q9NQZ2 ASAH1-236ENST00000636815 1724 ntTSL 517.84■□□□□ 0.451e-6■■■■■ 43.9
UTP3Q9NQZ2 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.441e-6■■■■■ 43.9
UTP3Q9NQZ2 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.421e-6■■■■■ 43.9
UTP3Q9NQZ2 ASAH1-243ENST00000637095 2048 ntTSL 517.3■□□□□ 0.361e-6■■■■■ 43.9
UTP3Q9NQZ2 ASAH1-212ENST00000523593 586 ntTSL 517.21■□□□□ 0.351e-6■■■■■ 43.9
UTP3Q9NQZ2 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.341e-6■■■■■ 43.9
UTP3Q9NQZ2 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.321e-6■■■■■ 43.9
UTP3Q9NQZ2 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.31e-6■■■■■ 43.9
UTP3Q9NQZ2 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.291e-6■■■■■ 43.9
UTP3Q9NQZ2 ASAH1-222ENST00000636160 2328 ntTSL 516.73■□□□□ 0.271e-6■■■■■ 43.9
UTP3Q9NQZ2 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.241e-6■■■■■ 43.9
UTP3Q9NQZ2 ASAH1-241ENST00000637013 2649 ntTSL 515.98■□□□□ 0.151e-6■■■■■ 43.9
UTP3Q9NQZ2 ASAH1-228ENST00000636494 1975 ntTSL 515.89■□□□□ 0.131e-6■■■■■ 43.9
UTP3Q9NQZ2 ASAH1-245ENST00000637244 3151 ntTSL 1 (best)15.73■□□□□ 0.111e-6■■■■■ 43.9
UTP3Q9NQZ2 ASAH1-247ENST00000637429 2558 ntTSL 515.72■□□□□ 0.111e-6■■■■■ 43.9
UTP3Q9NQZ2 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.081e-6■■■■■ 43.9
UTP3Q9NQZ2 ASAH1-207ENST00000519468 746 ntTSL 315.17■□□□□ 0.021e-6■■■■■ 43.9
UTP3Q9NQZ2 ASAH1-269ENST00000638069 3068 ntTSL 513.02□□□□□ -0.331e-6■■■■■ 43.9
UTP3Q9NQZ2 ASAH1-202ENST00000314146 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.391e-6■■■■■ 43.9
UTP3Q9NQZ2 ASAH1-226ENST00000636435 4611 ntTSL 212.24□□□□□ -0.451e-6■■■■■ 43.9
UTP3Q9NQZ2 ASAH1-225ENST00000636299 543 ntTSL 410.81□□□□□ -0.681e-6■■■■■ 43.9
UTP3Q9NQZ2 ASAH1-237ENST00000636823 571 ntTSL 410.4□□□□□ -0.741e-6■■■■■ 43.9
UTP3Q9NQZ2 ASAH1-256ENST00000637718 662 ntTSL 510.35□□□□□ -0.751e-6■■■■■ 43.9
UTP3Q9NQZ2 ASAH1-248ENST00000637484 2304 ntTSL 59.77□□□□□ -0.851e-6■■■■■ 43.9
UTP3Q9NQZ2 ASAH1-203ENST00000381733 2512 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.951e-6■■■■■ 43.9
UTP3Q9NQZ2 ASAH1-220ENST00000636050 2546 ntTSL 58.78□□□□□ -11e-6■■■■■ 43.9
UTP3Q9NQZ2 ASAH1-253ENST00000637609 4981 ntTSL 57.97□□□□□ -1.131e-6■■■■■ 43.9
UTP3Q9NQZ2 ASAH1-267ENST00000637991 2399 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.171e-6■■■■■ 43.9
UTP3Q9NQZ2 ASAH1-227ENST00000636455 1777 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.171e-6■■■■■ 43.9
UTP3Q9NQZ2 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.351e-6■■■■■ 43.9
UTP3Q9NQZ2 ASAH1-218ENST00000636009 2148 ntTSL 56.3□□□□□ -1.41e-6■■■■■ 43.9
UTP3Q9NQZ2 ASAH1-238ENST00000636828 3365 ntTSL 26.06□□□□□ -1.441e-6■■■■■ 43.9
UTP3Q9NQZ2 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.681e-6■■■■■ 43.9
UTP3Q9NQZ2 TARS-207ENST00000505012 608 ntTSL 49.82□□□□□ -0.845e-8■■■■■ 43.9
UTP3Q9NQZ2 ATP2A2-203ENST00000377685 5702 ntTSL 525.9■■□□□ 1.742e-6■■■■■ 43.8
UTP3Q9NQZ2 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.892e-6■■■■■ 43.8
UTP3Q9NQZ2 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.541e-7■■■■■ 43.8
UTP3Q9NQZ2 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.521e-7■■■■■ 43.8
UTP3Q9NQZ2 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.191e-7■■■■■ 43.8
UTP3Q9NQZ2 CRELD1-205ENST00000435417 966 ntTSL 515.28■□□□□ 0.041e-7■■■■■ 43.8
UTP3Q9NQZ2 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.011e-7■■■■■ 43.8
UTP3Q9NQZ2 ANKRD30BL-204ENST00000470729 1425 ntTSL 1 (best)18.49■□□□□ 0.557e-7■■■■■ 43.8
UTP3Q9NQZ2 NOP53-204ENST00000595143 810 ntTSL 521.22■□□□□ 0.993e-6■■■■■ 43.8
UTP3Q9NQZ2 NOP53-205ENST00000597985 656 ntTSL 315.88■□□□□ 0.133e-6■■■■■ 43.8
UTP3Q9NQZ2 NOP53-208ENST00000598959 501 ntTSL 510.95□□□□□ -0.663e-6■■■■■ 43.8
UTP3Q9NQZ2 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.788e-7■■■■■ 43.7
UTP3Q9NQZ2 AGRN-207ENST00000478677 276 ntTSL 212.67□□□□□ -0.386e-14■■■■■ 43.7
UTP3Q9NQZ2 H2AFZ-202ENST00000511203 1880 ntTSL 232.19■■■□□ 2.744e-7■■■■■ 43.7
UTP3Q9NQZ2 H2AFZ-203ENST00000511319 1254 ntTSL 1 (best)30.78■■■□□ 2.524e-7■■■■■ 43.7
UTP3Q9NQZ2 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.394e-7■■■■■ 43.7
UTP3Q9NQZ2 H2AFZ-204ENST00000511348 1843 ntTSL 1 (best)14.65□□□□□ -0.064e-7■■■■■ 43.7
UTP3Q9NQZ2 H2AFZ-205ENST00000527366 435 ntTSL 313.07□□□□□ -0.324e-7■■■■■ 43.7
UTP3Q9NQZ2 H2AFZ-206ENST00000529158 726 ntTSL 310.55□□□□□ -0.724e-7■■■■■ 43.7
UTP3Q9NQZ2 SELENOI-202ENST00000442141 504 ntTSL 58.27□□□□□ -1.091e-6■■■■■ 43.7
UTP3Q9NQZ2 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.623e-6■■■■■ 43.7
UTP3Q9NQZ2 SHISA5-218ENST00000497863 972 ntTSL 216.35■□□□□ 0.215e-20■■■■■ 43.7
UTP3Q9NQZ2 SHISA5-211ENST00000460758 1297 ntTSL 1 (best)13.6□□□□□ -0.235e-20■■■■■ 43.7
UTP3Q9NQZ2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.281e-6■■■■■ 43.7
UTP3Q9NQZ2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.251e-6■■■■■ 43.7
UTP3Q9NQZ2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.191e-6■■■■■ 43.7
UTP3Q9NQZ2 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.81e-6■■■■■ 43.7
UTP3Q9NQZ2 CIZ1-218ENST00000476727 1205 ntTSL 518.67■□□□□ 0.581e-6■■■■■ 43.7
UTP3Q9NQZ2 CIZ1-228ENST00000634901 3462 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.21e-6■■■■■ 43.7
UTP3Q9NQZ2 CIZ1-205ENST00000372948 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.231e-6■■■■■ 43.7
UTP3Q9NQZ2 CIZ1-201ENST00000277465 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.391e-6■■■■■ 43.7
UTP3Q9NQZ2 CIZ1-225ENST00000538431 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.421e-6■■■■■ 43.7
UTP3Q9NQZ2 CIZ1-207ENST00000393608 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.441e-6■■■■■ 43.7
UTP3Q9NQZ2 CIZ1-208ENST00000415526 2508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)11.53□□□□□ -0.561e-6■■■■■ 43.7
UTP3Q9NQZ2 VAPA-205ENST00000578314 532 ntTSL 324.38■■□□□ 1.491e-10■■■■■ 43.7
UTP3Q9NQZ2 IARS-205ENST00000443024 4341 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.191e-6■■■■■ 43.6
UTP3Q9NQZ2 IARS-206ENST00000447699 4186 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.241e-6■■■■■ 43.6
UTP3Q9NQZ2 IARS-202ENST00000375643 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.251e-6■■■■■ 43.6
UTP3Q9NQZ2 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.311e-6■■■■■ 43.6
UTP3Q9NQZ2 DCAF6-205ENST00000450548 724 ntTSL 319.48■□□□□ 0.712e-6■■■■■ 43.6
UTP3Q9NQZ2 DCAF6-209ENST00000470919 827 ntTSL 28.97□□□□□ -0.972e-6■■■■■ 43.6
UTP3Q9NQZ2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.65e-7■■■■■ 43.6
UTP3Q9NQZ2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.097e-7■■■■■ 43.6
UTP3Q9NQZ2 GOLGA4-209ENST00000450863 1617 ntTSL 520.87■□□□□ 0.937e-7■■■■■ 43.6
UTP3Q9NQZ2 GOLGA4-203ENST00000419177 760 ntTSL 317.65■□□□□ 0.427e-7■■■■■ 43.6
UTP3Q9NQZ2 GOLGA4-205ENST00000431105 568 ntTSL 315.57■□□□□ 0.087e-7■■■■■ 43.6
UTP3Q9NQZ2 GOLGA4-206ENST00000435830 4152 ntTSL 1 (best)10.88□□□□□ -0.677e-7■■■■■ 43.6
UTP3Q9NQZ2 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.724e-6■■■■■ 43.6
UTP3Q9NQZ2 SCARB1-209ENST00000545305 851 ntTSL 214.84□□□□□ -0.037e-7■■■■■ 43.6
UTP3Q9NQZ2 HMG20B-211ENST00000486028 719 ntTSL 213.29□□□□□ -0.287e-10■■■■■ 43.5
UTP3Q9NQZ2 RTL10-202ENST00000405640 6785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.092e-7■■■■■ 43.5
UTP3Q9NQZ2 RTL10-201ENST00000328554 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.032e-7■■■■■ 43.5
UTP3Q9NQZ2 RTL10-205ENST00000484072 1385 ntTSL 214.42□□□□□ -0.12e-7■■■■■ 43.5
UTP3Q9NQZ2 RTL10-203ENST00000407472 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.42e-7■■■■■ 43.5
UTP3Q9NQZ2 SEC13-211ENST00000431352 832 ntTSL 514.77□□□□□ -0.054e-6■■■■■ 43.5
UTP3Q9NQZ2 IMPDH2-201ENST00000326739 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.422e-7■■■■■ 43.5
UTP3Q9NQZ2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.941e-8■■■■■ 43.5
UTP3Q9NQZ2 ZNF639-207ENST00000491818 1228 ntTSL 524.59■■□□□ 1.531e-8■■■■■ 43.5
UTP3Q9NQZ2 CSNK1G2-206ENST00000589861 756 ntTSL 523.95■■□□□ 1.421e-8■■■■■ 43.5
UTP3Q9NQZ2 SDF4-206ENST00000478938 2591 ntTSL 222.52■■□□□ 1.21e-8■■■■■ 43.5
UTP3Q9NQZ2 CSNK1G2-211ENST00000615564 964 ntTSL 520.22■□□□□ 0.831e-8■■■■■ 43.5
UTP3Q9NQZ2 FOXK1-203ENST00000496023 1928 ntTSL 219.79■□□□□ 0.761e-8■■■■■ 43.5
UTP3Q9NQZ2 LRCH4-205ENST00000485554 774 ntTSL 318.87■□□□□ 0.611e-8■■■■■ 43.5
UTP3Q9NQZ2 KLHL17-202ENST00000463212 955 ntTSL 1 (best)18.06■□□□□ 0.481e-8■■■■■ 43.5
Retrieved 100 of 52,753 protein–RNA pairs in 4338.6 ms