Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6J3

SMAD5-AS1, SMAD5 antisense gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms