Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PAXBP1Q9Y5B6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAXBP1Q9Y5B6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms