Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B1

PRELID3B, PRELI domain containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID3BQ9Y3B1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRELID3BQ9Y3B1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRELID3BQ9Y3B1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRELID3BQ9Y3B1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PRELID3BQ9Y3B1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRELID3BQ9Y3B1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRELID3BQ9Y3B1 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRELID3BQ9Y3B1 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRELID3BQ9Y3B1 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRELID3BQ9Y3B1 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRELID3BQ9Y3B1 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRELID3BQ9Y3B1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRELID3BQ9Y3B1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRELID3BQ9Y3B1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRELID3BQ9Y3B1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRELID3BQ9Y3B1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRELID3BQ9Y3B1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRELID3BQ9Y3B1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PRELID3BQ9Y3B1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRELID3BQ9Y3B1 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRELID3BQ9Y3B1 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRELID3BQ9Y3B1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRELID3BQ9Y3B1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRELID3BQ9Y3B1 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRELID3BQ9Y3B1 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRELID3BQ9Y3B1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRELID3BQ9Y3B1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRELID3BQ9Y3B1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRELID3BQ9Y3B1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PRELID3BQ9Y3B1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRELID3BQ9Y3B1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRELID3BQ9Y3B1 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRELID3BQ9Y3B1 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
PRELID3BQ9Y3B1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRELID3BQ9Y3B1 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRELID3BQ9Y3B1 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms