Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y343

SNX24, Sorting nexin-24, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX24Q9Y343 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SNX24Q9Y343 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX24Q9Y343 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms