Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
THRAP3Q9Y2W1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
THRAP3Q9Y2W1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
THRAP3Q9Y2W1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
THRAP3Q9Y2W1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
THRAP3Q9Y2W1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
THRAP3Q9Y2W1 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
THRAP3Q9Y2W1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
THRAP3Q9Y2W1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
THRAP3Q9Y2W1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
THRAP3Q9Y2W1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
THRAP3Q9Y2W1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
THRAP3Q9Y2W1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
THRAP3Q9Y2W1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
THRAP3Q9Y2W1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
THRAP3Q9Y2W1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
THRAP3Q9Y2W1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
THRAP3Q9Y2W1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
THRAP3Q9Y2W1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
THRAP3Q9Y2W1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
THRAP3Q9Y2W1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
THRAP3Q9Y2W1 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
THRAP3Q9Y2W1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
THRAP3Q9Y2W1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
THRAP3Q9Y2W1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
THRAP3Q9Y2W1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
THRAP3Q9Y2W1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
THRAP3Q9Y2W1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
THRAP3Q9Y2W1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
THRAP3Q9Y2W1 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
THRAP3Q9Y2W1 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
THRAP3Q9Y2W1 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
THRAP3Q9Y2W1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
THRAP3Q9Y2W1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
THRAP3Q9Y2W1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
THRAP3Q9Y2W1 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
THRAP3Q9Y2W1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
THRAP3Q9Y2W1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
THRAP3Q9Y2W1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
THRAP3Q9Y2W1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
THRAP3Q9Y2W1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
THRAP3Q9Y2W1 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
THRAP3Q9Y2W1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
THRAP3Q9Y2W1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
THRAP3Q9Y2W1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
THRAP3Q9Y2W1 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
THRAP3Q9Y2W1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
THRAP3Q9Y2W1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
THRAP3Q9Y2W1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
THRAP3Q9Y2W1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
THRAP3Q9Y2W1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
THRAP3Q9Y2W1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
THRAP3Q9Y2W1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
THRAP3Q9Y2W1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
THRAP3Q9Y2W1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
THRAP3Q9Y2W1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
THRAP3Q9Y2W1 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
THRAP3Q9Y2W1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
THRAP3Q9Y2W1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
THRAP3Q9Y2W1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
THRAP3Q9Y2W1 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
THRAP3Q9Y2W1 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
THRAP3Q9Y2W1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
THRAP3Q9Y2W1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
THRAP3Q9Y2W1 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
THRAP3Q9Y2W1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
THRAP3Q9Y2W1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
THRAP3Q9Y2W1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
THRAP3Q9Y2W1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
THRAP3Q9Y2W1 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
THRAP3Q9Y2W1 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
THRAP3Q9Y2W1 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
THRAP3Q9Y2W1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
THRAP3Q9Y2W1 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
THRAP3Q9Y2W1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
THRAP3Q9Y2W1 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
THRAP3Q9Y2W1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
THRAP3Q9Y2W1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
THRAP3Q9Y2W1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
THRAP3Q9Y2W1 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
THRAP3Q9Y2W1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
THRAP3Q9Y2W1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
THRAP3Q9Y2W1 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
THRAP3Q9Y2W1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
THRAP3Q9Y2W1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
THRAP3Q9Y2W1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
THRAP3Q9Y2W1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
THRAP3Q9Y2W1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
THRAP3Q9Y2W1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
THRAP3Q9Y2W1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
THRAP3Q9Y2W1 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
THRAP3Q9Y2W1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
THRAP3Q9Y2W1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
THRAP3Q9Y2W1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
THRAP3Q9Y2W1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
THRAP3Q9Y2W1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
THRAP3Q9Y2W1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
THRAP3Q9Y2W1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
THRAP3Q9Y2W1 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
THRAP3Q9Y2W1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms