Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POMPQ9Y244 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POMPQ9Y244 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POMPQ9Y244 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POMPQ9Y244 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POMPQ9Y244 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POMPQ9Y244 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POMPQ9Y244 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POMPQ9Y244 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POMPQ9Y244 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POMPQ9Y244 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POMPQ9Y244 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POMPQ9Y244 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POMPQ9Y244 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POMPQ9Y244 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POMPQ9Y244 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POMPQ9Y244 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POMPQ9Y244 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POMPQ9Y244 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POMPQ9Y244 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POMPQ9Y244 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POMPQ9Y244 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POMPQ9Y244 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POMPQ9Y244 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POMPQ9Y244 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POMPQ9Y244 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POMPQ9Y244 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
POMPQ9Y244 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POMPQ9Y244 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POMPQ9Y244 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
POMPQ9Y244 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POMPQ9Y244 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POMPQ9Y244 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POMPQ9Y244 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POMPQ9Y244 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POMPQ9Y244 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POMPQ9Y244 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POMPQ9Y244 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POMPQ9Y244 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POMPQ9Y244 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POMPQ9Y244 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POMPQ9Y244 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POMPQ9Y244 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POMPQ9Y244 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POMPQ9Y244 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
POMPQ9Y244 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms