Protein–RNA interactions for Protein: Q9XRX5

HHLA3, HERV-H LTR-associating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA3Q9XRX5 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HHLA3Q9XRX5 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms