Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR5

SLC8A2, Sodium/calcium exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A2Q9UPR5 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC8A2Q9UPR5 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC8A2Q9UPR5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC8A2Q9UPR5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC8A2Q9UPR5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC8A2Q9UPR5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC8A2Q9UPR5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC8A2Q9UPR5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC8A2Q9UPR5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC8A2Q9UPR5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC8A2Q9UPR5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC8A2Q9UPR5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC8A2Q9UPR5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC8A2Q9UPR5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC8A2Q9UPR5 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC8A2Q9UPR5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC8A2Q9UPR5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC8A2Q9UPR5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC8A2Q9UPR5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC8A2Q9UPR5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC8A2Q9UPR5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC8A2Q9UPR5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC8A2Q9UPR5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC8A2Q9UPR5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC8A2Q9UPR5 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC8A2Q9UPR5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC8A2Q9UPR5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC8A2Q9UPR5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC8A2Q9UPR5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC8A2Q9UPR5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC8A2Q9UPR5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC8A2Q9UPR5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC8A2Q9UPR5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC8A2Q9UPR5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC8A2Q9UPR5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC8A2Q9UPR5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC8A2Q9UPR5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC8A2Q9UPR5 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC8A2Q9UPR5 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC8A2Q9UPR5 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC8A2Q9UPR5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC8A2Q9UPR5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC8A2Q9UPR5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC8A2Q9UPR5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC8A2Q9UPR5 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC8A2Q9UPR5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC8A2Q9UPR5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC8A2Q9UPR5 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC8A2Q9UPR5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC8A2Q9UPR5 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC8A2Q9UPR5 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC8A2Q9UPR5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC8A2Q9UPR5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC8A2Q9UPR5 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC8A2Q9UPR5 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC8A2Q9UPR5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC8A2Q9UPR5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC8A2Q9UPR5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC8A2Q9UPR5 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC8A2Q9UPR5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC8A2Q9UPR5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC8A2Q9UPR5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC8A2Q9UPR5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC8A2Q9UPR5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC8A2Q9UPR5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC8A2Q9UPR5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC8A2Q9UPR5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC8A2Q9UPR5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC8A2Q9UPR5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC8A2Q9UPR5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC8A2Q9UPR5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC8A2Q9UPR5 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC8A2Q9UPR5 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC8A2Q9UPR5 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC8A2Q9UPR5 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC8A2Q9UPR5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLC8A2Q9UPR5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC8A2Q9UPR5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC8A2Q9UPR5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC8A2Q9UPR5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC8A2Q9UPR5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC8A2Q9UPR5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC8A2Q9UPR5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC8A2Q9UPR5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC8A2Q9UPR5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC8A2Q9UPR5 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC8A2Q9UPR5 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC8A2Q9UPR5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC8A2Q9UPR5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC8A2Q9UPR5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC8A2Q9UPR5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC8A2Q9UPR5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC8A2Q9UPR5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC8A2Q9UPR5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC8A2Q9UPR5 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC8A2Q9UPR5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC8A2Q9UPR5 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC8A2Q9UPR5 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC8A2Q9UPR5 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC8A2Q9UPR5 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms